More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02222 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  68.21 
 
 
843 aa  1147    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 
853 aa  1718    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  43.51 
 
 
803 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  43.09 
 
 
797 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  42.74 
 
 
797 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 
797 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 
797 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  42.42 
 
 
812 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  42.42 
 
 
812 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  42.62 
 
 
817 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  43.29 
 
 
797 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  42.31 
 
 
812 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  40.22 
 
 
803 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  40.92 
 
 
795 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  40.54 
 
 
788 aa  549  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  41.34 
 
 
784 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  40.19 
 
 
788 aa  544  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  40.29 
 
 
795 aa  532  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.52 
 
 
800 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 
933 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  40 
 
 
924 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  36.9 
 
 
793 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  38.68 
 
 
800 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  36.66 
 
 
793 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  37.79 
 
 
853 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  36.34 
 
 
948 aa  492  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.65 
 
 
811 aa  485  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  38.48 
 
 
870 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 
918 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  38.33 
 
 
840 aa  479  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  37.78 
 
 
874 aa  471  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  36.31 
 
 
847 aa  466  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  36.77 
 
 
848 aa  465  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.74 
 
 
799 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 
811 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 
817 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 
795 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  35.37 
 
 
864 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 
887 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  35.81 
 
 
961 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 
861 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  36.8 
 
 
811 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 
858 aa  436  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 
851 aa  432  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 
842 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.21 
 
 
832 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 
868 aa  429  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  34 
 
 
835 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.49 
 
 
815 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 
857 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 
850 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  33.18 
 
 
821 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  35.51 
 
 
823 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 
924 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.52 
 
 
1015 aa  405  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  33.45 
 
 
884 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  33.75 
 
 
883 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 
871 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 
867 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  33.91 
 
 
856 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 
867 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  33.9 
 
 
867 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 
947 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 
804 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 
870 aa  376  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 
987 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 
815 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 
872 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.21 
 
 
847 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 
833 aa  358  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 
849 aa  352  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 
818 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 
858 aa  344  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 
869 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 
877 aa  337  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 
800 aa  330  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 
873 aa  320  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 
816 aa  306  9.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 
813 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 
885 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 
842 aa  278  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  31.57 
 
 
948 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 
852 aa  267  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 
879 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
873 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
869 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 
853 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28.06 
 
 
853 aa  170  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
838 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 
853 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 
853 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 
853 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
836 aa  162  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
842 aa  161  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 
841 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.47 
 
 
839 aa  157  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.99 
 
 
709 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 
855 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  25.4 
 
 
880 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 
843 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>