More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04865 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  53.24 
 
 		 795 aa  816    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  100 
 
 		 811 aa  1643    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  74.57 
 
 		 811 aa  1231    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  40.93 
 
 		 784 aa  531  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 795 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 843 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  37.58 
 
 		 793 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  37.33 
 
 		 793 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  38.82 
 
 		 795 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  36.34 
 
 		 853 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  37.22 
 
 		 788 aa  475  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 803 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.38 
 
 		 800 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  36.98 
 
 		 788 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 800 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 817 aa  458  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 812 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 812 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 797 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 812 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  37.82 
 
 		 811 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 797 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 797 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 797 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 		 803 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  37.15 
 
 		 842 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  35.45 
 
 		 797 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  34.04 
 
 		 840 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.84 
 
 		 799 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  34.81 
 
 		 821 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 948 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 815 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.06 
 
 		 832 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  33.9 
 
 		 961 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 874 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 918 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 835 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 887 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  33.26 
 
 		 833 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 933 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 853 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 847 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  34.76 
 
 		 884 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 924 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  32.77 
 
 		 864 aa  362  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  32.86 
 
 		 848 aa  362  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  34.77 
 
 		 883 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 871 aa  361  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 800 aa  360  5e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 817 aa  360  6e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  32.43 
 
 		 823 aa  359  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 924 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 850 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  32.62 
 
 		 870 aa  351  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.58 
 
 		 856 aa  351  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 868 aa  345  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 815 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 849 aa  342  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 804 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.4 
 
 		 867 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 947 aa  334  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 842 aa  333  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 867 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 867 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 858 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 		 847 aa  320  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 851 aa  318  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 987 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 816 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 818 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 885 aa  296  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 870 aa  295  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 813 aa  293  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 872 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  27.92 
 
 		 948 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 873 aa  276  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 852 aa  269  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 879 aa  258  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.4 
 
 		 1015 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 877 aa  191  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 858 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 861 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 857 aa  188  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 869 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 852 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 871 aa  161  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 861 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 855 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 847 aa  150  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 841 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  26.08 
 
 		 827 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 853 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 853 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 853 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 897 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 836 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 861 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  39.36 
 
 		 869 aa  108  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 861 aa  107  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 883 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>