More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5926 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 924 aa  1871    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  39.28 
 
 		 933 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  40.44 
 
 		 918 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  39.53 
 
 		 874 aa  597  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 887 aa  588  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  39.69 
 
 		 843 aa  548  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  39.35 
 
 		 924 aa  540  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 947 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  38.88 
 
 		 850 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  40 
 
 		 853 aa  510  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 987 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  36.74 
 
 		 817 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 812 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 797 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 797 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 812 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 812 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 797 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 797 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 		 803 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  41.16 
 
 		 948 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 803 aa  426  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  35.24 
 
 		 848 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 847 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 948 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  35.13 
 
 		 797 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 817 aa  409  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  34.18 
 
 		 788 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 853 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 788 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  33.91 
 
 		 870 aa  403  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  34.34 
 
 		 784 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 793 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  33.49 
 
 		 793 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 811 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.05 
 
 		 799 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  33.29 
 
 		 795 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 795 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.09 
 
 		 811 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 871 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  34.57 
 
 		 821 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 800 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.89 
 
 		 800 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 815 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 811 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 795 aa  365  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  33.17 
 
 		 864 aa  363  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.18 
 
 		 840 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 842 aa  353  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 868 aa  351  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  32.97 
 
 		 961 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  31.7 
 
 		 884 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  31.95 
 
 		 823 aa  330  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  32 
 
 		 883 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 847 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 800 aa  325  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 804 aa  323  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 835 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 851 aa  318  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 870 aa  313  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 858 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 861 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 867 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.55 
 
 		 867 aa  311  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 867 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 872 aa  308  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 857 aa  307  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.12 
 
 		 856 aa  306  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 816 aa  306  8.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 869 aa  304  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 818 aa  298  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.68 
 
 		 832 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 849 aa  280  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 877 aa  280  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 815 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 858 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 885 aa  268  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 873 aa  266  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 833 aa  265  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 813 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 842 aa  247  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 879 aa  231  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 852 aa  224  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.88 
 
 		 1015 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 843 aa  138  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.2 
 
 		 839 aa  138  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 836 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 817 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 757 aa  106  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 869 aa  104  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  42.07 
 
 		 873 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  42.68 
 
 		 873 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  39.55 
 
 		 841 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  39.43 
 
 		 849 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 847 aa  99.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 933 aa  99.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  39.29 
 
 		 855 aa  99.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 852 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 861 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>