More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1028 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 861 aa  1752    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  43.37 
 
 		 1015 aa  680    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  48.71 
 
 		 856 aa  771    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  77.7 
 
 		 870 aa  1321    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  52.58 
 
 		 877 aa  879    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  81.3 
 
 		 857 aa  1466    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  64.81 
 
 		 869 aa  1107    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  98.61 
 
 		 858 aa  1719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  81.46 
 
 		 851 aa  1442    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  97.69 
 
 		 867 aa  1712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  52.73 
 
 		 867 aa  823    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  96.19 
 
 		 867 aa  1684    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  37.41 
 
 		 823 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 868 aa  527  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  37.02 
 
 		 864 aa  525  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 853 aa  426  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 872 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 843 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 803 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 800 aa  412  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 797 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 797 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 797 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 797 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 817 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 812 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 812 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 812 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 847 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  31.95 
 
 		 797 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.59 
 
 		 800 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 795 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  31.67 
 
 		 784 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  32.25 
 
 		 840 aa  366  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 800 aa  360  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  30.85 
 
 		 848 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  29.84 
 
 		 793 aa  358  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 793 aa  357  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 948 aa  355  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  31.34 
 
 		 788 aa  353  1e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 788 aa  349  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  29.76 
 
 		 961 aa  346  8e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.42 
 
 		 799 aa  345  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 803 aa  340  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 853 aa  338  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.36 
 
 		 870 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 811 aa  335  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 811 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 918 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  30.18 
 
 		 821 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 815 aa  325  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 815 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 835 aa  320  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 874 aa  317  8e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 795 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 818 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 871 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 924 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 842 aa  303  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.56 
 
 		 832 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 847 aa  296  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 850 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 887 aa  281  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 947 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 833 aa  278  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 987 aa  273  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 849 aa  260  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 842 aa  256  9e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 924 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 813 aa  243  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 816 aa  238  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  34.42 
 
 		 795 aa  231  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  31.54 
 
 		 884 aa  207  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 883 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 817 aa  202  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 804 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.71 
 
 		 811 aa  189  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 		 948 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 933 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 861 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 861 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 861 aa  171  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 885 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 861 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  44.09 
 
 		 858 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 842 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 843 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.59 
 
 		 839 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 841 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 855 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 853 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 852 aa  138  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 855 aa  135  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  23.88 
 
 		 853 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 838 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 867 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 867 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 867 aa  128  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>