More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1490 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 948 aa  1908    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  37.67 
 
 		 933 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 987 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  41.16 
 
 		 924 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 948 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  34.25 
 
 		 870 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 918 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 871 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  35.49 
 
 		 887 aa  315  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 843 aa  311  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  28.69 
 
 		 864 aa  308  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 874 aa  305  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.46 
 
 		 799 aa  301  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.49 
 
 		 1015 aa  298  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 850 aa  298  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 869 aa  293  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 797 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 797 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 797 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.96 
 
 		 811 aa  280  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 817 aa  278  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 797 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 803 aa  274  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 947 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  32.97 
 
 		 788 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 870 aa  271  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 812 aa  271  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 788 aa  270  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 812 aa  270  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 811 aa  269  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 853 aa  267  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 812 aa  267  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 924 aa  260  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 817 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 803 aa  256  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  32.26 
 
 		 797 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 868 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  30.88 
 
 		 795 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 795 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 853 aa  229  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 872 aa  229  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 847 aa  221  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.78 
 
 		 800 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 800 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  30.38 
 
 		 848 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 858 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 811 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  28.92 
 
 		 784 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  31.26 
 
 		 823 aa  211  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 793 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  28.97 
 
 		 793 aa  206  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.14 
 
 		 867 aa  202  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 815 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 835 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  28.29 
 
 		 821 aa  199  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 800 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 795 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 842 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 847 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  27.4 
 
 		 884 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 883 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 961 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 857 aa  178  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 858 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.64 
 
 		 832 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 861 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 867 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 867 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 842 aa  174  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 851 aa  168  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 816 aa  168  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  28.05 
 
 		 840 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 818 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.36 
 
 		 856 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 833 aa  164  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 877 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 815 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 885 aa  147  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  23.71 
 
 		 873 aa  140  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 879 aa  125  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 852 aa  117  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 813 aa  111  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 849 aa  110  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 935 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 935 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 935 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  36.76 
 
 		 884 aa  95.9  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 871 aa  95.9  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  38.95 
 
 		 883 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  38.95 
 
 		 883 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 847 aa  94.7  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 883 aa  95.1  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 933 aa  94.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 937 aa  94.7  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  36.6 
 
 		 839 aa  94  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 861 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 861 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 857 aa  93.2  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 861 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>