More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0349 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 850 aa  1717    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  38.88 
 
 		 924 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 987 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 843 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 933 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 887 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  35.36 
 
 		 918 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  36.65 
 
 		 874 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 947 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 853 aa  398  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 924 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 817 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 797 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 797 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  35.22 
 
 		 797 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 812 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 812 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  35.22 
 
 		 797 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 803 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 812 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  33.78 
 
 		 848 aa  350  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.43 
 
 		 811 aa  349  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 847 aa  347  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  34.39 
 
 		 870 aa  345  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  32.43 
 
 		 788 aa  343  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  32.52 
 
 		 797 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 795 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 788 aa  339  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 883 aa  333  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 803 aa  333  9e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 817 aa  332  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  32.93 
 
 		 784 aa  331  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  31.67 
 
 		 840 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 811 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.13 
 
 		 800 aa  326  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 800 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 853 aa  325  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 815 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 793 aa  323  6e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.6 
 
 		 821 aa  323  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.85 
 
 		 793 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  31.35 
 
 		 961 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 811 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 795 aa  320  7.999999999999999e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 		 847 aa  320  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 948 aa  318  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.62 
 
 		 856 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 842 aa  313  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 804 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 871 aa  310  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 835 aa  307  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  31.14 
 
 		 795 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 815 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  29.85 
 
 		 884 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 800 aa  300  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  34.95 
 
 		 948 aa  298  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 818 aa  297  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 858 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 861 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.26 
 
 		 832 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  29.39 
 
 		 864 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 851 aa  279  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 868 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 842 aa  274  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 885 aa  273  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 813 aa  271  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.65 
 
 		 799 aa  266  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.62 
 
 		 867 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 823 aa  262  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 833 aa  259  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 867 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 873 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  26.74 
 
 		 1015 aa  254  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 867 aa  251  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 858 aa  244  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 852 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 872 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 849 aa  233  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 879 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 857 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 869 aa  177  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 870 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 877 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 869 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 842 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 904 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 904 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 872 aa  104  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 904 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 855 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 882 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 855 aa  99.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  31.65 
 
 		 839 aa  99.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 946 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 838 aa  99  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 841 aa  99  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  40.13 
 
 		 935 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  40.13 
 
 		 935 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  40.13 
 
 		 935 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>