More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1623 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  84.22 
 
 		 930 aa  1627    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 935 aa  1911    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  85.64 
 
 		 936 aa  1667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  75.51 
 
 		 933 aa  1452    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 935 aa  1911    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  84.22 
 
 		 930 aa  1627    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  84.01 
 
 		 930 aa  1625    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  75.72 
 
 		 937 aa  1462    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 935 aa  1911    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  40.18 
 
 		 935 aa  622  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 981 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 953 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 1088 aa  477  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 966 aa  473  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  33.99 
 
 		 966 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 965 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 838 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  33.81 
 
 		 853 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  33.81 
 
 		 853 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  33.81 
 
 		 853 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 843 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 836 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 907 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 853 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  34.25 
 
 		 853 aa  432  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 987 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  33.85 
 
 		 839 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 855 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 841 aa  425  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 842 aa  422  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 952 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 855 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 985 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 907 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 912 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 873 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 869 aa  406  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 981 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 974 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 975 aa  402  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 873 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 944 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  34.63 
 
 		 709 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 938 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 901 aa  375  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 904 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 904 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 904 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 904 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 817 aa  363  9e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 897 aa  360  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 924 aa  351  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  29.48 
 
 		 914 aa  348  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 948 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 966 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  31.12 
 
 		 929 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 957 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 946 aa  335  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 924 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 924 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 924 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 947 aa  333  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 910 aa  330  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 944 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 951 aa  327  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 869 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 967 aa  319  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 951 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 891 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 872 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 876 aa  311  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 871 aa  311  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 		 961 aa  310  8e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 875 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 861 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 861 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 973 aa  304  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 861 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 935 aa  304  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 969 aa  300  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.03 
 
 		 969 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 940 aa  298  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 861 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 861 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 861 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 852 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 855 aa  294  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  28.48 
 
 		 899 aa  293  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.67 
 
 		 895 aa  290  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 869 aa  287  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 847 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 1009 aa  283  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 883 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 890 aa  278  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.55 
 
 		 1007 aa  278  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 890 aa  277  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.66 
 
 		 893 aa  277  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 849 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 1007 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1015 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>