More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1632 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 929 aa  1896    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  40.97 
 
 		 948 aa  675    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  54.23 
 
 		 966 aa  1028    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  41.74 
 
 		 1040 aa  713    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 958 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 958 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.9 
 
 		 969 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 907 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 966 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  30.13 
 
 		 961 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 907 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 944 aa  362  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 965 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 951 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 924 aa  347  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 935 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 1020 aa  346  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 935 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 935 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 966 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 869 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 951 aa  342  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 957 aa  337  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 912 aa  334  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 937 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 946 aa  332  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 935 aa  325  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.56 
 
 		 966 aa  324  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  30.82 
 
 		 936 aa  318  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 933 aa  317  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 873 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 947 aa  311  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 914 aa  310  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 873 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 981 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 901 aa  302  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 930 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 930 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 930 aa  301  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 904 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 976 aa  297  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 904 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 987 aa  296  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 904 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 935 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 969 aa  295  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 940 aa  294  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 897 aa  293  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 938 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 904 aa  291  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 964 aa  288  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 953 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 838 aa  283  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  29.47 
 
 		 839 aa  280  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 976 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 842 aa  271  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1028 aa  271  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 853 aa  270  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.22 
 
 		 853 aa  269  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 939 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 855 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 1088 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 843 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 853 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 853 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 853 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.88 
 
 		 1007 aa  260  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 855 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 974 aa  259  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 1007 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  30.81 
 
 		 709 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1007 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1007 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 910 aa  254  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 841 aa  254  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 985 aa  253  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 998 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 869 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 892 aa  249  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 847 aa  248  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 855 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 836 aa  245  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 975 aa  244  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 817 aa  237  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 861 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 861 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 861 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 1015 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 861 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 861 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 861 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 891 aa  233  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 886 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 852 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 886 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 952 aa  229  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 882 aa  228  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 882 aa  228  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.38 
 
 		 914 aa  227  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 875 aa  224  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>