More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2263 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  53.26 
 
 		 1007 aa  1030    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1015 aa  2080    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  53.53 
 
 		 1007 aa  1038    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  53.63 
 
 		 1007 aa  1041    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  54.24 
 
 		 1007 aa  1044    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  61.89 
 
 		 1009 aa  1280    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 951 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 966 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 957 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 947 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 944 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 946 aa  328  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 951 aa  318  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 969 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 966 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 935 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 967 aa  294  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.71 
 
 		 966 aa  293  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1057 aa  292  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 940 aa  291  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.3 
 
 		 936 aa  290  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 938 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 953 aa  287  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 933 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 937 aa  280  9e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 935 aa  280  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 935 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 935 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 935 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 930 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 930 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 930 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 981 aa  268  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 965 aa  268  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 939 aa  267  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 897 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 966 aa  265  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 964 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 976 aa  262  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.36 
 
 		 914 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 987 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 1000 aa  259  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 1088 aa  257  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1028 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 904 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 904 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 904 aa  253  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 904 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 944 aa  251  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1020 aa  249  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 974 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 981 aa  245  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 901 aa  244  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 975 aa  243  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 948 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 982 aa  241  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.69 
 
 		 969 aa  241  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 924 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 1004 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 907 aa  238  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 1041 aa  238  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 910 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  26.46 
 
 		 929 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 987 aa  234  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 985 aa  234  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 869 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 914 aa  232  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  26.5 
 
 		 961 aa  231  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 912 aa  231  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 1041 aa  229  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 976 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1068 aa  224  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 907 aa  222  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 1040 aa  221  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.89 
 
 		 839 aa  221  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 824 aa  218  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 836 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 843 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 855 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 873 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 841 aa  212  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 855 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 873 aa  209  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  26.13 
 
 		 1015 aa  208  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.74 
 
 		 853 aa  207  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 853 aa  205  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 842 aa  205  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 958 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 958 aa  202  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 927 aa  199  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 838 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 874 aa  198  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 853 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 853 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 879 aa  197  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 853 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 925 aa  195  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  25.77 
 
 		 922 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 952 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 928 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>