More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3556 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  38.15 
 
 		 987 aa  678    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  45.57 
 
 		 975 aa  818    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 981 aa  657    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  46.12 
 
 		 974 aa  803    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 944 aa  1949    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  43.82 
 
 		 985 aa  790    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  44.34 
 
 		 952 aa  795    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 953 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 930 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 930 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 930 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 937 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.94 
 
 		 936 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 935 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 935 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 935 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 935 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 933 aa  399  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 965 aa  376  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1088 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 981 aa  361  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  29.41 
 
 		 914 aa  347  5e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.54 
 
 		 966 aa  340  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 853 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 853 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 853 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 966 aa  334  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  30.01 
 
 		 853 aa  333  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 853 aa  333  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 897 aa  331  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 869 aa  330  7e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 924 aa  330  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 907 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 907 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 904 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 855 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 838 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 873 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 904 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 904 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 904 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 855 aa  310  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 901 aa  309  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 873 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 910 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 843 aa  297  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 912 aa  296  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 842 aa  295  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 841 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 891 aa  290  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 836 aa  288  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 875 aa  288  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.35 
 
 		 839 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 869 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 935 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 938 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 944 aa  278  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.82 
 
 		 880 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 966 aa  271  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 901 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 852 aa  268  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 957 aa  267  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 951 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 967 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 861 aa  266  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 855 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 861 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 861 aa  265  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 884 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 890 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 890 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 861 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 861 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 861 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  28.12 
 
 		 709 aa  261  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 966 aa  258  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 890 aa  257  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.79 
 
 		 969 aa  257  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 817 aa  257  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 871 aa  256  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 857 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 969 aa  253  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 882 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 849 aa  252  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 882 aa  252  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 847 aa  250  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 904 aa  250  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 927 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 964 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 924 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 924 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 924 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 909 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 892 aa  248  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 928 aa  248  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 1007 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  28.03 
 
 		 877 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 956 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 1015 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 866 aa  242  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>