More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3083 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  43.78 
 
 		 924 aa  709    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  43.04 
 
 		 907 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 912 aa  1867    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  44.7 
 
 		 907 aa  743    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 869 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 873 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 873 aa  438  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 935 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 935 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 935 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 930 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 930 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 966 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 930 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  32.31 
 
 		 936 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 937 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 933 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 965 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 935 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  32.83 
 
 		 966 aa  399  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 897 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 904 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 904 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 904 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 904 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 981 aa  346  8.999999999999999e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 953 aa  345  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  31.3 
 
 		 929 aa  344  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 944 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 836 aa  340  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 841 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 838 aa  335  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 842 aa  333  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 948 aa  333  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 901 aa  331  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 938 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 966 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 843 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 855 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 853 aa  324  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 987 aa  319  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  30.17 
 
 		 853 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 910 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 855 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 853 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 853 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 853 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  29.53 
 
 		 839 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 981 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 975 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 944 aa  304  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 976 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 876 aa  301  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 1088 aa  300  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 974 aa  298  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 952 aa  298  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 869 aa  298  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 985 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 957 aa  293  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 924 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 924 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 924 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 875 aa  291  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.38 
 
 		 969 aa  291  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 940 aa  289  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 966 aa  286  9e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 951 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.71 
 
 		 961 aa  283  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 947 aa  282  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 951 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 967 aa  281  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 969 aa  281  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 868 aa  280  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 976 aa  280  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 817 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 946 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 871 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 869 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 1020 aa  273  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 861 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 958 aa  271  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 861 aa  271  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 1040 aa  270  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 861 aa  270  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 958 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.17 
 
 		 884 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  29.9 
 
 		 709 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 883 aa  263  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 883 aa  263  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 849 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 935 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 861 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 861 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 861 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 883 aa  262  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 855 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 857 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 882 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 852 aa  254  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.21 
 
 		 914 aa  254  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>