More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2653 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 940 aa  1921    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 951 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 938 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 966 aa  399  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 957 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 947 aa  386  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 951 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 946 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 944 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 1028 aa  353  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 965 aa  342  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 869 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 969 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 967 aa  327  5e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 987 aa  326  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1007 aa  320  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 952 aa  318  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 933 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.06 
 
 		 1007 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 937 aa  313  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 935 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 935 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 935 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.59 
 
 		 929 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 935 aa  309  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 1007 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 1007 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 964 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 930 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 930 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 930 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 1015 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.22 
 
 		 936 aa  298  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 912 aa  296  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 907 aa  296  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 910 aa  296  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 904 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 976 aa  295  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 948 aa  295  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1009 aa  293  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 873 aa  291  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 939 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 904 aa  291  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 975 aa  290  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 935 aa  290  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 897 aa  289  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 904 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 873 aa  288  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 974 aa  284  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 904 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 966 aa  281  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 907 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 966 aa  278  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 914 aa  274  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 924 aa  273  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 920 aa  270  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 901 aa  265  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  29.75 
 
 		 961 aa  266  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 976 aa  264  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 1040 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 981 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 842 aa  260  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 953 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 944 aa  255  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 841 aa  252  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.29 
 
 		 839 aa  250  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 843 aa  247  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 875 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 838 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 861 aa  244  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 861 aa  244  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 861 aa  244  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 855 aa  240  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 852 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  24.97 
 
 		 914 aa  238  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.41 
 
 		 969 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 922 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 861 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 861 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 849 aa  234  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 861 aa  233  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 871 aa  231  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  25.98 
 
 		 1015 aa  229  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 958 aa  229  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 958 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 855 aa  226  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 847 aa  225  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1020 aa  224  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 855 aa  223  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 836 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 824 aa  223  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 853 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 853 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 853 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 857 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.78 
 
 		 853 aa  220  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 869 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 853 aa  217  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  26.08 
 
 		 893 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  26.74 
 
 		 899 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>