More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4318 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 976 aa  1946    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  41.17 
 
 		 976 aa  668    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 998 aa  621  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 935 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  31.7 
 
 		 961 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 901 aa  352  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 907 aa  350  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 897 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 1040 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 1020 aa  339  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 951 aa  336  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.98 
 
 		 969 aa  335  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 907 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 947 aa  333  8e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 924 aa  330  8e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 966 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 1057 aa  318  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 869 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 944 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 948 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 946 aa  302  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 966 aa  302  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 957 aa  302  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 920 aa  300  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 912 aa  300  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 904 aa  300  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 904 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 904 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 904 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 967 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 873 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 951 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 958 aa  282  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 873 aa  281  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 958 aa  280  7e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.13 
 
 		 929 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 939 aa  278  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 938 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 922 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 965 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1000 aa  267  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 969 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 836 aa  263  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 981 aa  263  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 935 aa  263  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 1015 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 1007 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 1007 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 966 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 940 aa  257  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 964 aa  257  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 914 aa  252  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1004 aa  251  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1007 aa  251  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.84 
 
 		 1007 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 841 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 975 aa  248  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 843 aa  247  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 944 aa  243  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 1028 aa  242  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.6 
 
 		 853 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.91 
 
 		 914 aa  240  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 853 aa  239  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  25.98 
 
 		 966 aa  239  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 853 aa  237  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 853 aa  237  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 853 aa  237  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.65 
 
 		 839 aa  235  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1034 aa  234  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 1032 aa  234  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 838 aa  233  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 855 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 910 aa  233  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 953 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 855 aa  232  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 985 aa  230  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 842 aa  230  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 987 aa  228  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 1041 aa  226  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 1009 aa  226  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 933 aa  225  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 824 aa  224  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.01 
 
 		 936 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 981 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 937 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 1041 aa  221  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 935 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 935 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 935 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 987 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 817 aa  218  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 974 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 869 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 875 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 866 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 930 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 930 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 852 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 891 aa  209  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 930 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>