More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1674 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  46.42 
 
 		 944 aa  844    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 951 aa  1955    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 966 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 957 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 946 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 951 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 947 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 969 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 967 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 939 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 938 aa  370  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 966 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 940 aa  362  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.09 
 
 		 966 aa  350  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  29.72 
 
 		 1007 aa  350  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 937 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 929 aa  347  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 920 aa  347  8e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1007 aa  344  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1007 aa  343  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 869 aa  343  9e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 922 aa  340  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 964 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 933 aa  334  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 935 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 981 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 935 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 935 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 935 aa  331  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 965 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.56 
 
 		 936 aa  326  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 930 aa  326  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 930 aa  326  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 1007 aa  325  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 935 aa  323  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 1057 aa  323  7e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 930 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 948 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 873 aa  320  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 873 aa  319  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 952 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 1015 aa  313  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 843 aa  311  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 897 aa  310  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 907 aa  310  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 1009 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.49 
 
 		 961 aa  308  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 1028 aa  307  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 904 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 904 aa  300  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 904 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 904 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 841 aa  295  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  28.41 
 
 		 839 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 907 aa  288  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 855 aa  287  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 1040 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 836 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 842 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 901 aa  282  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 982 aa  281  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 855 aa  281  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28.36 
 
 		 853 aa  279  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 976 aa  278  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 912 aa  278  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 853 aa  277  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 853 aa  277  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 976 aa  277  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 853 aa  277  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 953 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 824 aa  274  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 853 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.83 
 
 		 969 aa  273  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 875 aa  270  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 838 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 987 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1032 aa  266  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 924 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 914 aa  266  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 1041 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 869 aa  260  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 925 aa  259  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1000 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 974 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  27.23 
 
 		 914 aa  251  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 1020 aa  251  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  27.34 
 
 		 922 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  29.7 
 
 		 709 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 871 aa  240  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 849 aa  240  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 944 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 901 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 998 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 817 aa  234  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 872 aa  233  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 987 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 852 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 904 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 909 aa  232  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.44 
 
 		 877 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>