More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00553 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1028 aa  2070    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 969 aa  426  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 967 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 957 aa  412  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 951 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 1057 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 946 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 966 aa  383  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 947 aa  364  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 940 aa  335  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 944 aa  326  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 824 aa  324  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 951 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 939 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 933 aa  291  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 922 aa  291  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 981 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 976 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 930 aa  278  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 930 aa  278  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 930 aa  277  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 873 aa  270  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 966 aa  267  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.04 
 
 		 929 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 873 aa  267  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 907 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 1032 aa  260  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 948 aa  257  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 924 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 920 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1015 aa  255  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.56 
 
 		 966 aa  255  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1007 aa  253  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 1020 aa  251  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 1009 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.17 
 
 		 969 aa  241  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 987 aa  241  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 944 aa  240  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 981 aa  239  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 975 aa  237  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.06 
 
 		 961 aa  236  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 976 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 1041 aa  234  6e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 1041 aa  231  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1000 aa  228  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 935 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 869 aa  218  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 982 aa  213  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 875 aa  211  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 855 aa  211  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 855 aa  206  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 974 aa  204  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1004 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  24.02 
 
 		 914 aa  195  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 965 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 953 aa  185  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 914 aa  183  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 938 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 966 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 912 aa  174  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 1007 aa  172  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 1068 aa  171  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 912 aa  171  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 937 aa  171  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 1007 aa  171  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 869 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  30.11 
 
 		 936 aa  168  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 935 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 904 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1006 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.6 
 
 		 1007 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 904 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 935 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 935 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 935 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 904 aa  161  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 904 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 909 aa  157  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  27.17 
 
 		 1015 aa  157  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 952 aa  155  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 1088 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 1040 aa  151  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  24.02 
 
 		 895 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 964 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 896 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 907 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 998 aa  149  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  25 
 
 		 827 aa  147  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 841 aa  144  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 942 aa  144  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 910 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 987 aa  142  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 897 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  38.93 
 
 		 843 aa  140  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  38.63 
 
 		 836 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 973 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  40.77 
 
 		 838 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 901 aa  135  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  39.48 
 
 		 839 aa  134  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  39.74 
 
 		 853 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>