More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1437 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 958 aa  1957    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  41.17 
 
 		 948 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  99.48 
 
 		 958 aa  1945    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 1040 aa  509  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 966 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  35.17 
 
 		 929 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.53 
 
 		 969 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  30.05 
 
 		 961 aa  354  4e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 1020 aa  340  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 907 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 935 aa  295  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 924 aa  283  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 907 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 976 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 914 aa  260  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 912 aa  257  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 935 aa  257  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 981 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 939 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 869 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 953 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 897 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 965 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 966 aa  241  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.4 
 
 		 936 aa  240  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 966 aa  240  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 951 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 957 aa  234  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 935 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 935 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 935 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 873 aa  230  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 930 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 930 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 930 aa  227  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 947 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 873 aa  226  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 964 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 922 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 946 aa  223  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 937 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 843 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 901 aa  219  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 853 aa  217  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 904 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 904 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.71 
 
 		 853 aa  214  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 933 aa  214  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 975 aa  211  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 904 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 853 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 1007 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 904 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 1007 aa  210  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 940 aa  210  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  25.4 
 
 		 1007 aa  210  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 853 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 853 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 842 aa  208  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 938 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.29 
 
 		 966 aa  208  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 967 aa  205  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 841 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 838 aa  204  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 952 aa  203  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 855 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1015 aa  199  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 1088 aa  197  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 1009 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 855 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.33 
 
 		 914 aa  195  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 951 aa  194  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 944 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 861 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 982 aa  194  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 861 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 861 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 857 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 855 aa  191  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 852 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 836 aa  186  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  24.64 
 
 		 839 aa  184  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  24.51 
 
 		 922 aa  183  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 875 aa  183  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 849 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.6 
 
 		 709 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 884 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 861 aa  179  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 861 aa  179  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 861 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 925 aa  177  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 987 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 944 aa  173  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 847 aa  171  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 985 aa  167  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 944 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 869 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 998 aa  165  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 817 aa  164  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 1055 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>