More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1589 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 998 aa  2024    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  38.45 
 
 		 976 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  38.97 
 
 		 976 aa  627  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 935 aa  345  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 951 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 961 aa  311  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 920 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 939 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 944 aa  298  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 1020 aa  298  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 901 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 922 aa  281  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 947 aa  277  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 957 aa  277  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1040 aa  275  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.08 
 
 		 969 aa  271  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 948 aa  270  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 897 aa  260  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 1007 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 966 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 966 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.49 
 
 		 1007 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 914 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1007 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  25.6 
 
 		 929 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1007 aa  253  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 912 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 907 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 907 aa  247  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 1000 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 953 aa  243  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 946 aa  241  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 904 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 1057 aa  239  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 987 aa  238  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.6 
 
 		 880 aa  238  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 904 aa  238  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 967 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 951 aa  234  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 904 aa  234  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.88 
 
 		 877 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 904 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 1015 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 924 aa  228  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 904 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 1004 aa  228  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 944 aa  225  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 935 aa  223  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 969 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 987 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 981 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 1032 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 966 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 901 aa  210  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 938 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  25.73 
 
 		 936 aa  208  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 933 aa  208  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 937 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.04 
 
 		 914 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 1009 aa  202  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 930 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 930 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 930 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.01 
 
 		 966 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 910 aa  195  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 935 aa  192  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 935 aa  192  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 935 aa  192  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 884 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 956 aa  191  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 836 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 985 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 1041 aa  181  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 1041 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 855 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 1088 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 879 aa  179  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 965 aa  178  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 855 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 950 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 901 aa  174  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  23.44 
 
 		 1015 aa  173  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 975 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 855 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4602  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 875 aa  171  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.683128  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 869 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 958 aa  165  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 958 aa  165  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 940 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 974 aa  159  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 883 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 883 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 883 aa  157  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 982 aa  156  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 875 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 935 aa  153  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 894 aa  152  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 890 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 1028 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.25 
 
 		 884 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>