More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0268 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  100 
 
 		 877 aa  1791    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  98.18 
 
 		 904 aa  1768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  63.89 
 
 		 884 aa  1126    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  81 
 
 		 901 aa  1476    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  64.19 
 
 		 880 aa  1154    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 854 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 879 aa  317  8e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 891 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  30.65 
 
 		 884 aa  292  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 883 aa  291  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 855 aa  290  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 874 aa  290  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.31 
 
 		 827 aa  290  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 883 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 883 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 852 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  30.38 
 
 		 834 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 847 aa  283  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 869 aa  283  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 875 aa  278  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 953 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 941 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 941 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 941 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 861 aa  272  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 861 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 861 aa  271  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 857 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 861 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 861 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 871 aa  270  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 866 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.77 
 
 		 866 aa  267  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 861 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 896 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 849 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 906 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 906 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 906 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.99 
 
 		 893 aa  262  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  28.14 
 
 		 899 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 935 aa  256  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 890 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 890 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 924 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 924 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 924 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 890 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 928 aa  252  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 935 aa  253  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.4 
 
 		 895 aa  252  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 872 aa  252  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 903 aa  251  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 944 aa  250  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 927 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 907 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 965 aa  247  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 944 aa  247  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 893 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 914 aa  243  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 869 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 985 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 855 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 853 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 913 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 894 aa  238  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 841 aa  238  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 935 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 935 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 853 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 853 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 935 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28.41 
 
 		 853 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 869 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 853 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 909 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 981 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 855 aa  235  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 843 aa  233  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 842 aa  233  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 930 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 930 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 975 aa  231  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 951 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 892 aa  231  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 909 aa  230  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 951 aa  230  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 948 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 930 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.28 
 
 		 936 aa  229  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 957 aa  229  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 836 aa  228  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 838 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 998 aa  227  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 817 aa  226  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 944 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 907 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 937 aa  224  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 894 aa  224  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 873 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>