More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1752 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1041 aa  2132    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  99.04 
 
 		 1041 aa  2113    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 1032 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 947 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 951 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 957 aa  294  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 966 aa  292  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 969 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 967 aa  282  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 1057 aa  281  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 951 aa  264  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 944 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1028 aa  253  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 981 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 975 aa  233  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 981 aa  232  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.94 
 
 		 969 aa  232  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 824 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 1015 aa  227  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 985 aa  226  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 976 aa  224  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 939 aa  221  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 937 aa  221  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 920 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 935 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 922 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 933 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 976 aa  215  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.81 
 
 		 936 aa  214  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 946 aa  206  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 907 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 907 aa  194  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 924 aa  191  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 901 aa  187  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1000 aa  185  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1034 aa  177  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 935 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 935 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 935 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 987 aa  171  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 1004 aa  168  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 928 aa  166  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 927 aa  164  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 956 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 966 aa  155  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 938 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  23.5 
 
 		 914 aa  152  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 1068 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 875 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 965 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 974 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 930 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 930 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 930 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 897 aa  145  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 904 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  25.33 
 
 		 966 aa  144  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 940 aa  142  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 1088 aa  141  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 869 aa  140  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  23.42 
 
 		 961 aa  139  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 952 aa  138  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 935 aa  138  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 1007 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 904 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 912 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 904 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  25.86 
 
 		 1007 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1007 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1007 aa  136  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 1009 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 904 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 924 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 924 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 924 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 982 aa  130  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  36.58 
 
 		 836 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 944 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 869 aa  126  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 953 aa  126  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  35.74 
 
 		 922 aa  124  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 1001 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 873 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 873 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  35.29 
 
 		 839 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 948 aa  120  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  35.29 
 
 		 709 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 843 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 966 aa  119  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 841 aa  119  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  38.46 
 
 		 853 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 855 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 853 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  25.67 
 
 		 929 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 817 aa  115  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  37.69 
 
 		 857 aa  115  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 838 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>