More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2535 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  48.23 
 
 		 966 aa  851    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 966 aa  1976    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 937 aa  502  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  34.81 
 
 		 936 aa  478  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 935 aa  473  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 965 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 935 aa  473  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 935 aa  473  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 907 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 981 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 933 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 907 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 930 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 930 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 930 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 		 935 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 952 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 869 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 912 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 981 aa  406  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 987 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 924 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 957 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 873 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 873 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 966 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 843 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  31.33 
 
 		 853 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 938 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 841 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 853 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 951 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 946 aa  366  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 842 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  31.81 
 
 		 929 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 948 aa  361  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 855 aa  360  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 853 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 838 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 853 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 853 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 904 aa  357  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 953 aa  355  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 836 aa  354  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 904 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 944 aa  353  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 855 aa  353  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 974 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 904 aa  348  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 904 aa  348  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 951 aa  343  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 966 aa  340  9e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 947 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  28.7 
 
 		 839 aa  337  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 944 aa  334  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1088 aa  330  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 897 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 975 aa  328  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 985 aa  326  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 817 aa  315  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 961 aa  313  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 973 aa  312  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 876 aa  311  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 901 aa  310  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 1015 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  27.98 
 
 		 914 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 969 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 869 aa  297  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 1020 aa  296  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 896 aa  295  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 882 aa  294  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 1009 aa  293  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 882 aa  293  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 		 709 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 868 aa  286  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 849 aa  286  9e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 982 aa  283  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 909 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 852 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 935 aa  272  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 869 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 872 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 855 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 875 aa  267  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 940 aa  266  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1040 aa  266  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.84 
 
 		 969 aa  264  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 924 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 924 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 924 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 847 aa  262  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 1007 aa  260  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 1007 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  25.6 
 
 		 1007 aa  260  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 871 aa  253  9.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 861 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 861 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 976 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 890 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 861 aa  253  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>