More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4602 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2859  TonB-dependent receptor  67.36 
 
 		 902 aa  1095    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115194  normal  0.0892472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4602  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 875 aa  1744    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.683128  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 981 aa  363  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 1000 aa  318  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 1020 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 879 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 869 aa  193  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 901 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  27.03 
 
 		 877 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 904 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 874 aa  188  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 952 aa  187  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 875 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  25.84 
 
 		 827 aa  183  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2047  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 803 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 981 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 985 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 897 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 869 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 874 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 910 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.16 
 
 		 880 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 884 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 836 aa  174  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 998 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 843 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 924 aa  169  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 1055 aa  168  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 941 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 909 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 941 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 901 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 941 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 950 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 935 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 913 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.8 
 
 		 853 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 914 aa  161  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 841 aa  160  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 853 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 853 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 939 aa  160  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 924 aa  160  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 935 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 853 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 854 aa  159  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 906 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 906 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 981 aa  157  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 906 aa  157  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 896 aa  157  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 894 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 838 aa  153  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.89 
 
 		 914 aa  153  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 853 aa  154  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 966 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.67 
 
 		 839 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 935 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 907 aa  151  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 903 aa  150  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 924 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 855 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 924 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 924 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 855 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 709 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 966 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 873 aa  146  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 873 aa  144  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 974 aa  142  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 876 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 893 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 890 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 872 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 958 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 890 aa  137  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 868 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 958 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.24 
 
 		 884 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 869 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 890 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 942 aa  134  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  24.69 
 
 		 866 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 800 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 883 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 883 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 856 aa  131  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 922 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 883 aa  129  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 908 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 914 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 891 aa  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 965 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 871 aa  124  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.1 
 
 		 969 aa  124  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 954 aa  122  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2660  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 979 aa  121  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.436942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 861 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 861 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 861 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>