More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3289 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 924 aa  1885    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 901 aa  379  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 894 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 879 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 875 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 910 aa  210  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 869 aa  204  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 871 aa  203  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2660  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 979 aa  196  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.436942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 852 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 981 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4016  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 1015 aa  191  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  25.03 
 
 		 936 aa  190  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 857 aa  190  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 897 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 924 aa  187  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 855 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 937 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 933 aa  184  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 907 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 930 aa  181  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 950 aa  181  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 930 aa  181  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 930 aa  180  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 847 aa  180  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 861 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 861 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 861 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 849 aa  179  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 861 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 991 aa  177  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 935 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 935 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 935 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 861 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 861 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 907 aa  174  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 892 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 956 aa  171  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 981 aa  171  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 1055 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  26.63 
 
 		 827 aa  170  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 944 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 928 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 941 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 941 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 904 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 904 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 941 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1455  TonB-dependent receptor, plug  25.73 
 
 		 1040 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 904 aa  164  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 882 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 904 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 869 aa  162  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  25.55 
 
 		 877 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 882 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 987 aa  158  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 904 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 952 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 894 aa  156  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 953 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 927 aa  154  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 976 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 935 aa  154  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 1009 aa  153  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 935 aa  152  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 1088 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 868 aa  152  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 924 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 924 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 924 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 944 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 906 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 906 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 906 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 939 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 876 aa  146  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 901 aa  146  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 942 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 914 aa  144  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 946 aa  144  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 869 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  24.59 
 
 		 966 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 874 aa  142  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 913 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 966 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 908 aa  137  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 1000 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  23.54 
 
 		 974 aa  134  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 987 aa  134  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.17 
 
 		 880 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1004 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 922 aa  128  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  25.81 
 
 		 1015 aa  128  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 998 aa  127  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 867 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 867 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 951 aa  126  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 867 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 867 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>