More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2353 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  46.44 
 
 		 973 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 908 aa  1844    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  47.64 
 
 		 846 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  39.4 
 
 		 942 aa  603  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 892 aa  586  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 912 aa  585  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 985 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 935 aa  432  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  30.91 
 
 		 866 aa  336  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 890 aa  292  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 895 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 896 aa  281  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 925 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.24 
 
 		 893 aa  268  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  27.71 
 
 		 922 aa  264  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 872 aa  248  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 869 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03700  TonB-dependent outer membrane receptor  34.29 
 
 		 532 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 861 aa  235  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 861 aa  235  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 874 aa  234  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 909 aa  232  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 861 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 944 aa  231  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 982 aa  231  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 852 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  25.98 
 
 		 827 aa  229  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 857 aa  228  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 896 aa  228  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 873 aa  227  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 875 aa  226  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 861 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 861 aa  224  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 861 aa  224  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 879 aa  224  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 948 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 847 aa  220  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 927 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 956 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 800 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 873 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 869 aa  212  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 838 aa  211  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 928 aa  209  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 907 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.03 
 
 		 884 aa  208  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.81 
 
 		 914 aa  207  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 869 aa  206  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 907 aa  205  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 946 aa  204  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 868 aa  204  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 944 aa  203  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 876 aa  197  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 883 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 883 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 904 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 883 aa  195  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 944 aa  195  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 991 aa  195  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 904 aa  194  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 941 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 941 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 941 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 904 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 904 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 853 aa  189  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 913 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 981 aa  185  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  24.59 
 
 		 834 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 901 aa  183  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 981 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 953 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 817 aa  181  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 924 aa  179  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 914 aa  179  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 906 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 906 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 906 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03701  TonB-dependent outer membrane receptor  45.07 
 
 		 311 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  43.81 
 
 		 899 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  25.87 
 
 		 877 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 890 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  26.3 
 
 		 961 aa  174  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 1000 aa  174  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 890 aa  174  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 904 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 951 aa  170  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 965 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 1064 aa  163  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 922 aa  162  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 935 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 958 aa  156  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 958 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 1015 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 903 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 935 aa  154  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 891 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 976 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 893 aa  152  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 914 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>