More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2871 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 935 aa  1922    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 892 aa  580  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 912 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 908 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 973 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 942 aa  389  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 985 aa  333  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 890 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 890 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  27.36 
 
 		 922 aa  235  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 890 aa  230  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  26.34 
 
 		 899 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 925 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.69 
 
 		 884 aa  224  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 927 aa  224  6e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 883 aa  224  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 928 aa  222  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 944 aa  221  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  25.74 
 
 		 866 aa  218  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 883 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 883 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 991 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 930 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 924 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 924 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 924 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 930 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 930 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 952 aa  206  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 935 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 935 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 935 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 893 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 875 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 981 aa  197  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 869 aa  197  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 879 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 852 aa  194  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  24.9 
 
 		 936 aa  190  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 847 aa  185  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 909 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 871 aa  183  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 944 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 933 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 937 aa  178  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 909 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 944 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 974 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 910 aa  173  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 967 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 941 aa  171  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 941 aa  171  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 948 aa  170  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 941 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 893 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 956 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 907 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 1015 aa  163  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 896 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 935 aa  162  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 913 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 867 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 873 aa  155  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 867 aa  154  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 867 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 867 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 953 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03700  TonB-dependent outer membrane receptor  27.95 
 
 		 532 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 901 aa  146  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 951 aa  146  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 924 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 950 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 969 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 1009 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 903 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 940 aa  137  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  24.87 
 
 		 914 aa  137  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 958 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 912 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03701  TonB-dependent outer membrane receptor  43.32 
 
 		 311 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 958 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 946 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 947 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 981 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 897 aa  131  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 901 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 939 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 987 aa  129  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.34 
 
 		 969 aa  128  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 874 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  32.8 
 
 		 895 aa  125  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 896 aa  125  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 894 aa  124  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 924 aa  123  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 975 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 914 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 1055 aa  121  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 892 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 914 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>