More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7317 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  100 
 
 
903 aa  1835    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  56.52 
 
 
935 aa  954    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  56.16 
 
 
913 aa  926    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  70.9 
 
 
941 aa  1360    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  55.18 
 
 
906 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  55.52 
 
 
906 aa  899    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  53.9 
 
 
914 aa  932    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  55.18 
 
 
906 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  70.9 
 
 
941 aa  1360    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  71.01 
 
 
941 aa  1360    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  53.33 
 
 
893 aa  888    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 
874 aa  522  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  36.51 
 
 
879 aa  484  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
869 aa  304  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 
927 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.9 
 
 
827 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 
928 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 
948 aa  281  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 
875 aa  275  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 
901 aa  270  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  28.97 
 
 
877 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 
852 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28.97 
 
 
904 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 
884 aa  257  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.34 
 
 
880 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
944 aa  254  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
847 aa  250  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 
861 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 
861 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 
861 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
871 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
849 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 
855 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
861 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
861 aa  244  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
861 aa  243  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  28.46 
 
 
834 aa  242  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 
891 aa  239  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
867 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
867 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
867 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
857 aa  234  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 
950 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 
866 aa  232  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 
867 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
910 aa  226  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 
868 aa  226  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
886 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
886 aa  225  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 
882 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
854 aa  224  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 
953 aa  224  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
991 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 
882 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
1001 aa  222  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  26.29 
 
 
895 aa  222  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 
1055 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 
869 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
872 aa  212  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  26.31 
 
 
866 aa  211  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
892 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
1064 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 
912 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  24.89 
 
 
899 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
876 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
909 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
956 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
894 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 
896 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 
925 aa  198  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
944 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  25.43 
 
 
922 aa  194  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
873 aa  193  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 
800 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.61 
 
 
914 aa  191  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
883 aa  190  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 
843 aa  188  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
933 aa  188  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  25 
 
 
909 aa  188  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.66 
 
 
884 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 
974 aa  185  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
873 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 
841 aa  185  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 
952 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
894 aa  184  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
883 aa  184  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
883 aa  184  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
907 aa  181  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 
975 aa  181  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
901 aa  181  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
874 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 
869 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
935 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  24.61 
 
 
839 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 
853 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.8 
 
 
853 aa  179  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 
853 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 
853 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
853 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  25 
 
 
897 aa  175  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>