More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1499 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  78.64 
 
 		 892 aa  1459    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 894 aa  1824    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  73.3 
 
 		 886 aa  1316    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  74.53 
 
 		 882 aa  1341    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  73.19 
 
 		 886 aa  1315    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  74.53 
 
 		 882 aa  1343    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 891 aa  475  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 869 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 868 aa  373  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 876 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 896 aa  364  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 909 aa  360  8e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 872 aa  351  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 909 aa  347  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 890 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 883 aa  337  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 883 aa  337  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 890 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 883 aa  333  9e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 890 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 855 aa  327  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.84 
 
 		 884 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 847 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 966 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 852 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 861 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  30.59 
 
 		 827 aa  306  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 861 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 861 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 924 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 924 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 924 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 800 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 857 aa  298  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 861 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 861 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 861 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 869 aa  296  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 875 aa  292  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 907 aa  291  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 873 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 935 aa  287  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 948 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 849 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 842 aa  283  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 873 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 871 aa  282  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 924 aa  280  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 907 aa  280  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.48 
 
 		 899 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 855 aa  270  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 933 aa  270  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 841 aa  269  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 937 aa  268  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 896 aa  268  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 843 aa  267  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  28.29 
 
 		 895 aa  265  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 901 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.96 
 
 		 966 aa  261  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 853 aa  261  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 855 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  28.99 
 
 		 839 aa  260  8e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28.56 
 
 		 853 aa  259  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 838 aa  259  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 836 aa  258  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 935 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 935 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 935 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 853 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 853 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 853 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 869 aa  252  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 930 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 987 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 930 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 930 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 912 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 893 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 904 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.35 
 
 		 866 aa  248  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 953 aa  247  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  27.71 
 
 		 877 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 904 aa  244  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  27.23 
 
 		 936 aa  243  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 904 aa  243  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 904 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 879 aa  241  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 904 aa  240  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 981 aa  238  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 975 aa  237  8e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 897 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 866 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  27.37 
 
 		 929 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 967 aa  228  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 867 aa  227  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 867 aa  227  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 985 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 867 aa  224  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 950 aa  224  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 956 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>