More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2169 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1064 aa  2166    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 948 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1001 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 927 aa  271  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 928 aa  269  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 944 aa  255  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 879 aa  244  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 874 aa  230  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 906 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 906 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 906 aa  214  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  26.11 
 
 		 827 aa  207  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 941 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 941 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 941 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 914 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 913 aa  197  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 903 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 991 aa  194  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 935 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 891 aa  181  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 893 aa  179  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 910 aa  172  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 935 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 861 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 861 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 861 aa  165  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  25.46 
 
 		 866 aa  164  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 861 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 861 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 861 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 908 aa  162  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 852 aa  162  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 935 aa  160  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 935 aa  160  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 935 aa  160  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 933 aa  159  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 930 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  24.47 
 
 		 899 aa  157  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 930 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 930 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  24.37 
 
 		 895 aa  156  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 857 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 951 aa  153  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1000 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 894 aa  152  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 952 aa  150  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 953 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  23.37 
 
 		 893 aa  145  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 847 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 890 aa  141  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  22.48 
 
 		 896 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 896 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 869 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 935 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 956 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 876 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 907 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 924 aa  135  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 924 aa  135  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 924 aa  135  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 901 aa  134  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 957 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 985 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 946 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 944 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 883 aa  131  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 883 aa  131  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 892 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 1055 aa  127  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1004 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 854 aa  124  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 924 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 882 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 882 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  39.08 
 
 		 904 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  38.98 
 
 		 973 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 976 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 966 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  39.08 
 
 		 904 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.16 
 
 		 914 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  38.51 
 
 		 904 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  38.51 
 
 		 904 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  33.47 
 
 		 880 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 875 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 966 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 849 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 947 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 855 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 871 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 886 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 886 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 1015 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  36.17 
 
 		 834 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 942 aa  111  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 843 aa  110  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 904 aa  108  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 950 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 836 aa  108  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  32.86 
 
 		 877 aa  108  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>