More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1120 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 942 aa  1929    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  54.13 
 
 		 912 aa  986    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  38.74 
 
 		 908 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  37.16 
 
 		 892 aa  571  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  36.98 
 
 		 846 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 973 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 935 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 985 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 925 aa  300  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  28.19 
 
 		 866 aa  296  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  28.84 
 
 		 922 aa  291  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 896 aa  263  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  26.15 
 
 		 895 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 890 aa  252  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 890 aa  248  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 893 aa  243  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 874 aa  241  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 879 aa  238  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03700  TonB-dependent outer membrane receptor  33.96 
 
 		 532 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 875 aa  230  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 861 aa  225  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 861 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 941 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 861 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 941 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 861 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 941 aa  222  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 861 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 861 aa  220  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 857 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 965 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 882 aa  218  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 944 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 882 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 981 aa  214  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 872 aa  214  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 924 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 924 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 924 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 869 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.98 
 
 		 936 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 894 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 869 aa  204  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 894 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 935 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 935 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 935 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 967 aa  200  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 876 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 946 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 897 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 892 aa  199  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 957 aa  197  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 869 aa  195  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 982 aa  195  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 951 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 966 aa  191  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 893 aa  188  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 873 aa  187  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 944 aa  187  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 800 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 935 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 952 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 907 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 907 aa  186  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.26 
 
 		 914 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 948 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 873 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 947 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 950 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 910 aa  172  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 935 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 924 aa  164  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 914 aa  163  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1455  TonB-dependent receptor, plug  23.57 
 
 		 1040 aa  162  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 1055 aa  161  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  40.45 
 
 		 890 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 966 aa  153  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 914 aa  152  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  38.14 
 
 		 899 aa  151  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 922 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 954 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 924 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 891 aa  149  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 938 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 940 aa  147  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 		 1001 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 1028 aa  147  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 849 aa  146  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 852 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 939 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 853 aa  142  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  39.83 
 
 		 841 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 855 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  38.24 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  39.37 
 
 		 843 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  38.03 
 
 		 855 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  37.33 
 
 		 987 aa  140  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 838 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  37.39 
 
 		 853 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>