More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2119 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  43.91 
 
 		 896 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  41.96 
 
 		 899 aa  679    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  43.45 
 
 		 893 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  99.44 
 
 		 890 aa  1816    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 890 aa  1824    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  43.87 
 
 		 895 aa  713    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  97.19 
 
 		 890 aa  1768    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  36.94 
 
 		 866 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 891 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  31.42 
 
 		 922 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 925 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 883 aa  349  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  31.41 
 
 		 884 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 883 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 883 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 924 aa  344  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 924 aa  344  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 924 aa  344  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  31 
 
 		 827 aa  343  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 861 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 861 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 861 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 872 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 855 aa  328  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 852 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 894 aa  320  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 847 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 857 aa  318  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 875 aa  317  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 861 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 861 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 861 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 886 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 886 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 869 aa  312  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 842 aa  312  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 892 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 874 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 882 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 882 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 849 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 869 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 867 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 867 aa  297  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 909 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 867 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 853 aa  294  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 853 aa  294  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 867 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 853 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 871 aa  293  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 853 aa  291  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 855 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.41 
 
 		 853 aa  290  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 896 aa  288  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 937 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 841 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 935 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 843 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  30.17 
 
 		 839 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 855 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 927 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 909 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 836 aa  281  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.39 
 
 		 936 aa  279  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 866 aa  278  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 935 aa  277  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 935 aa  277  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 935 aa  277  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 956 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 879 aa  274  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 930 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 928 aa  273  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 930 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 930 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 973 aa  270  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.14 
 
 		 880 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 910 aa  269  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 901 aa  267  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 933 aa  266  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 838 aa  265  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 817 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 846 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 944 aa  262  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 800 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 974 aa  261  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 869 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 904 aa  258  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.61 
 
 		 966 aa  257  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 944 aa  256  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 873 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  27.03 
 
 		 877 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 892 aa  253  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 966 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 975 aa  249  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 873 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  26.96 
 
 		 834 aa  244  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 944 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 985 aa  243  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 924 aa  240  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>