More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3760 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 967 aa  1957    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  57.82 
 
 		 824 aa  939    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  62.04 
 
 		 969 aa  1238    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 957 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  37.2 
 
 		 951 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 946 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 966 aa  512  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 947 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 944 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 1028 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 1057 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 951 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 966 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 965 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 873 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 920 aa  328  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 935 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 935 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 935 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 930 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 930 aa  322  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 930 aa  322  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 939 aa  321  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 937 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 940 aa  316  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 935 aa  316  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 938 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 855 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.05 
 
 		 936 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 981 aa  308  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 922 aa  308  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 841 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.38 
 
 		 969 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 953 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 924 aa  301  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 843 aa  300  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 897 aa  300  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 933 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 855 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 1015 aa  298  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.51 
 
 		 966 aa  296  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 842 aa  292  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 987 aa  291  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 1007 aa  289  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 981 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 935 aa  288  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 1007 aa  288  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  29.13 
 
 		 1007 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 853 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 964 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 853 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 853 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 975 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 961 aa  281  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 912 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 976 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.97 
 
 		 839 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1041 aa  275  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 914 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 836 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 1041 aa  272  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 976 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 901 aa  272  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 944 aa  272  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.3 
 
 		 884 aa  266  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 1032 aa  266  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 883 aa  263  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 883 aa  263  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 1020 aa  260  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 1000 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 974 aa  258  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 883 aa  257  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 985 aa  251  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 876 aa  249  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 910 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 982 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 872 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 924 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 709 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 924 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 924 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 892 aa  237  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 909 aa  235  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  26.51 
 
 		 1015 aa  235  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 869 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  25.69 
 
 		 895 aa  233  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  26.05 
 
 		 899 aa  232  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1004 aa  230  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 998 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 868 aa  227  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 894 aa  225  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1088 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 896 aa  221  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  26.76 
 
 		 827 aa  220  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 875 aa  218  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 869 aa  217  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 886 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.83 
 
 		 929 aa  214  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 886 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 909 aa  212  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>