More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2373 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 966 aa  1973    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  56.89 
 
 		 947 aa  1098    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  69.65 
 
 		 951 aa  1379    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  54.63 
 
 		 946 aa  1059    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  77.11 
 
 		 957 aa  1551    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  37 
 
 		 944 aa  557  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 967 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 951 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 969 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 1057 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 869 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 922 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 981 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 873 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 940 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1028 aa  383  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 966 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 965 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 873 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  31.43 
 
 		 966 aa  372  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1015 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 938 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 824 aa  365  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 937 aa  357  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 930 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 930 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 935 aa  353  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 930 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 920 aa  350  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 933 aa  346  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 935 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 935 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 935 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 939 aa  343  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.91 
 
 		 929 aa  340  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 966 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1007 aa  337  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 1007 aa  336  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 1007 aa  336  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 953 aa  334  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.6 
 
 		 1007 aa  333  9e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.96 
 
 		 936 aa  325  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 1009 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 948 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 907 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 976 aa  320  9e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 897 aa  317  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 841 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 855 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 907 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 935 aa  315  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 843 aa  312  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 924 aa  311  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 901 aa  309  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 842 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 853 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.56 
 
 		 961 aa  305  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  30.07 
 
 		 853 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 952 aa  304  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 855 aa  303  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 838 aa  303  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 981 aa  300  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.46 
 
 		 969 aa  300  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 853 aa  297  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 853 aa  297  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 987 aa  297  8e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 853 aa  297  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 924 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 924 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 924 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 976 aa  293  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 964 aa  293  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 975 aa  290  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 914 aa  290  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1000 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 904 aa  277  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 904 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 944 aa  271  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 912 aa  270  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 982 aa  270  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 891 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 904 aa  268  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 1040 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 904 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1020 aa  264  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.16 
 
 		 914 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 998 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 985 aa  254  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 1004 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 974 aa  252  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 709 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 1088 aa  251  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  25.96 
 
 		 1015 aa  251  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  26.49 
 
 		 893 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 958 aa  241  5e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 958 aa  240  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 896 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 869 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 849 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 1032 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>