More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3438 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  98.23 
 
 		 904 aa  1849    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 904 aa  1877    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  46.41 
 
 		 897 aa  792    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  47.22 
 
 		 901 aa  781    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  97.12 
 
 		 904 aa  1829    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  97.46 
 
 		 904 aa  1831    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  36.66 
 
 		 869 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 873 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 873 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  34.49 
 
 		 907 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 907 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 953 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 981 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 843 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 853 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 853 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 853 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 853 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  33.86 
 
 		 853 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 842 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 935 aa  402  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 841 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  32.8 
 
 		 839 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 855 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 855 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 817 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 924 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 838 aa  395  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 836 aa  389  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 965 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 933 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 930 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 937 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 935 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 930 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 912 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 930 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 935 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 935 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  30.41 
 
 		 936 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 966 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.28 
 
 		 966 aa  343  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  35.07 
 
 		 709 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1088 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 952 aa  331  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 938 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 981 aa  327  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 975 aa  325  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 987 aa  323  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 976 aa  321  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 985 aa  317  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 944 aa  316  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 974 aa  314  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 957 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 946 aa  303  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 951 aa  301  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 944 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 951 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  27.01 
 
 		 929 aa  297  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 935 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 976 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 947 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 940 aa  282  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 910 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 966 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 966 aa  270  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 969 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 961 aa  264  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 964 aa  263  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 914 aa  262  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 855 aa  262  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 857 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 852 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 861 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 861 aa  260  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 861 aa  260  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 1020 aa  258  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 948 aa  258  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 861 aa  257  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 847 aa  255  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 861 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 861 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 849 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 1007 aa  251  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 867 aa  251  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 871 aa  249  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1015 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 867 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 886 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  25.99 
 
 		 1015 aa  247  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 886 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.13 
 
 		 914 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 875 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.98 
 
 		 1007 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 867 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 867 aa  244  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 892 aa  243  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1034 aa  243  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 1009 aa  241  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 882 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>