More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0820 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 975 aa  2008    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 		 987 aa  700    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 		 981 aa  695    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  66.5 
 
 		 974 aa  1357    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  52.98 
 
 		 985 aa  978    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  45.28 
 
 		 944 aa  823    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  47.53 
 
 		 952 aa  853    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 935 aa  428  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 935 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 935 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 935 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 937 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 930 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 930 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 930 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  31 
 
 		 936 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 981 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 953 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 933 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 965 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 1088 aa  361  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 907 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 869 aa  336  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 966 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 907 aa  334  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 873 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  28.88 
 
 		 914 aa  332  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.3 
 
 		 966 aa  331  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 897 aa  332  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 873 aa  330  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 904 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 904 aa  327  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 904 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 904 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 912 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 938 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 966 aa  302  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 841 aa  301  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 924 aa  300  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 855 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 853 aa  297  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 944 aa  296  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 901 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 843 aa  295  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 855 aa  294  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.46 
 
 		 853 aa  291  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 838 aa  291  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 957 aa  289  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 967 aa  285  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 853 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 853 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 969 aa  283  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.81 
 
 		 839 aa  281  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 853 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 946 aa  280  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 836 aa  280  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 951 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 940 aa  277  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 947 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 842 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 875 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 924 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 709 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 924 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 924 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 910 aa  263  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 855 aa  263  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.65 
 
 		 899 aa  259  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 890 aa  258  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 890 aa  257  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 909 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 817 aa  254  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 890 aa  253  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 896 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 869 aa  251  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.35 
 
 		 969 aa  251  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 852 aa  250  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.69 
 
 		 1007 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 1007 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.63 
 
 		 929 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 964 aa  248  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 935 aa  247  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1007 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 928 aa  244  5e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 1007 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 871 aa  244  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 901 aa  243  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  26.09 
 
 		 895 aa  242  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 894 aa  242  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 1028 aa  241  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 927 aa  240  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 861 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 861 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 893 aa  239  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 847 aa  238  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 882 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 861 aa  239  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 861 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1015 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 861 aa  237  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>