More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02110 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  57.82 
 
 		 967 aa  962    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 824 aa  1664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  58.06 
 
 		 969 aa  979    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 957 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 951 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 946 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 947 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 966 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 1028 aa  339  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 944 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 951 aa  291  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 1057 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 935 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 914 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 966 aa  251  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 1041 aa  248  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 922 aa  248  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1041 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 939 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.82 
 
 		 969 aa  234  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1040 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 1015 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 924 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 938 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 965 aa  230  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 961 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 981 aa  227  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 981 aa  227  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 987 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 953 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.62 
 
 		 929 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 964 aa  223  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 873 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 944 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 976 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 873 aa  221  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 869 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 940 aa  218  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 982 aa  214  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 966 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 975 aa  212  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 952 aa  210  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 930 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 930 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 985 aa  208  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 935 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 935 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 935 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 907 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 920 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 907 aa  208  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 937 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 930 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 1032 aa  207  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 933 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 1020 aa  202  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 897 aa  201  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.03 
 
 		 936 aa  200  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1009 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 948 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 935 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 855 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 855 aa  195  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1007 aa  194  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 1007 aa  191  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 1007 aa  190  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 974 aa  190  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 904 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 904 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 904 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 		 966 aa  183  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.31 
 
 		 1007 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  24.38 
 
 		 853 aa  180  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 838 aa  177  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 901 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  24.41 
 
 		 839 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 836 aa  174  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 1068 aa  173  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 841 aa  173  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 853 aa  173  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 912 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 842 aa  170  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 843 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 869 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  26.62 
 
 		 1015 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 910 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 1000 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 1004 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 976 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 958 aa  160  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 958 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 987 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 950 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 904 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 875 aa  153  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.96 
 
 		 884 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  23.62 
 
 		 895 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  22.14 
 
 		 896 aa  148  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 998 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1088 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>