More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1516 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 933 aa  1910    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  74.84 
 
 		 936 aa  1459    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  76.18 
 
 		 930 aa  1487    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  76.07 
 
 		 930 aa  1486    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  75.51 
 
 		 935 aa  1471    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  75.51 
 
 		 935 aa  1471    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  75.51 
 
 		 935 aa  1471    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  90.3 
 
 		 937 aa  1730    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  76.07 
 
 		 930 aa  1486    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  39.67 
 
 		 935 aa  620  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 981 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 853 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 953 aa  477  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 1088 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 966 aa  475  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  35.45 
 
 		 853 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 853 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 853 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 853 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 965 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  34.06 
 
 		 966 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 838 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 907 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 907 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 841 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 855 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 869 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 836 aa  439  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 843 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 987 aa  435  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 873 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 842 aa  432  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  33.05 
 
 		 839 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 855 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 873 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 985 aa  426  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 952 aa  419  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 981 aa  416  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 944 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 912 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 974 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 938 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  34.26 
 
 		 709 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 904 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 975 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 904 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 904 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 904 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 924 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 901 aa  369  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 817 aa  365  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 897 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 966 aa  360  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 944 aa  347  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 957 aa  340  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  28.98 
 
 		 914 aa  340  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 948 aa  336  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 951 aa  333  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.64 
 
 		 929 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 947 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 946 aa  329  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 869 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 951 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 910 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 891 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 872 aa  313  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 924 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 875 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 924 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 924 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 940 aa  304  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 967 aa  303  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 852 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 876 aa  302  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 935 aa  301  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 861 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 868 aa  297  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 855 aa  297  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 861 aa  296  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 861 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 869 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  27 
 
 		 1009 aa  294  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 1028 aa  293  8e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  30.12 
 
 		 961 aa  290  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 849 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 861 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 861 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 861 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 1015 aa  287  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  29.28 
 
 		 899 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.9 
 
 		 969 aa  283  8.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 956 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 871 aa  282  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1007 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1007 aa  281  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.71 
 
 		 1007 aa  280  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1007 aa  278  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 973 aa  277  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 847 aa  272  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 857 aa  272  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>