More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3063 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  91.16 
 
 
1007 aa  1856    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  54.24 
 
 
1015 aa  1050    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  94.94 
 
 
1007 aa  1941    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  94.94 
 
 
1007 aa  1941    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 
1007 aa  2058    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  55.82 
 
 
1009 aa  1044    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
951 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 
944 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 
951 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 
946 aa  344  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 
947 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 
957 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 
966 aa  336  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
935 aa  326  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
938 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 
939 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 
969 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
940 aa  303  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 
967 aa  302  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 
933 aa  300  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
937 aa  294  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
935 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
935 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
935 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 
930 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 
930 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
930 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 
869 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 
965 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 
981 aa  286  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
966 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
964 aa  280  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 
920 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.02 
 
 
966 aa  277  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
952 aa  275  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 
907 aa  274  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 
953 aa  273  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.96 
 
 
936 aa  272  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 
1020 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
966 aa  268  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.15 
 
 
929 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
897 aa  267  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 
976 aa  266  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 
982 aa  265  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 
1088 aa  261  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.87 
 
 
914 aa  261  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
975 aa  259  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 
974 aa  258  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
998 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
904 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.4 
 
 
969 aa  256  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
1040 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
987 aa  255  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 
935 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
904 aa  254  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
922 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  26.71 
 
 
961 aa  253  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
976 aa  252  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 
944 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
901 aa  244  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 
985 aa  244  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
873 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 
948 aa  240  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
873 aa  240  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
910 aa  239  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 
1000 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
924 aa  237  9e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
843 aa  235  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 
987 aa  235  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 
1004 aa  234  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
981 aa  233  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
836 aa  233  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.63 
 
 
839 aa  232  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
912 aa  230  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
841 aa  228  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
907 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
855 aa  227  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 
855 aa  225  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
853 aa  225  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.23 
 
 
853 aa  224  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 
853 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 
853 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 
853 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
842 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
958 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 
958 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
838 aa  211  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 
914 aa  207  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 
896 aa  206  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  26.06 
 
 
893 aa  205  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 
895 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 
1068 aa  201  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
852 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 
861 aa  195  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
956 aa  194  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
861 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 
861 aa  193  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 
855 aa  191  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  25.03 
 
 
709 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 
849 aa  189  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>