More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3321 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  40.44 
 
 		 952 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  43.62 
 
 		 985 aa  741    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  42.06 
 
 		 974 aa  708    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  41.01 
 
 		 975 aa  697    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 987 aa  2027    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  66.03 
 
 		 981 aa  1342    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  38.15 
 
 		 944 aa  678    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 935 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 953 aa  452  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 930 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 930 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 930 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  30.94 
 
 		 936 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 935 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 935 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 935 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 937 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 981 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 933 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 1088 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 966 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 965 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  30.24 
 
 		 914 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 869 aa  347  8e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.15 
 
 		 966 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 907 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 907 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 924 aa  325  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 904 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 904 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 873 aa  322  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 904 aa  321  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 873 aa  320  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 904 aa  318  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 940 aa  313  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 897 aa  312  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 912 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 938 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 842 aa  303  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 969 aa  298  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 966 aa  297  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.11 
 
 		 929 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 891 aa  295  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 838 aa  294  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 841 aa  293  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 855 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 967 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 855 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 843 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 901 aa  284  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.41 
 
 		 969 aa  283  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 957 aa  283  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 951 aa  278  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 853 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.6 
 
 		 853 aa  273  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 892 aa  273  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 935 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 946 aa  273  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 853 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 853 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 853 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.92 
 
 		 839 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 966 aa  268  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 869 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 951 aa  263  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 910 aa  263  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 944 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1015 aa  258  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 947 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 836 aa  255  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 924 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 924 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 924 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 894 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 909 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 872 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  25.85 
 
 		 1007 aa  243  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 1007 aa  241  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 909 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 976 aa  241  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 982 aa  239  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 890 aa  237  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1007 aa  237  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 874 aa  237  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 890 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1007 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 973 aa  234  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 961 aa  234  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 964 aa  232  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 956 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  27.72 
 
 		 709 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.77 
 
 		 880 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 927 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 1040 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 901 aa  221  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 884 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 925 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 869 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 928 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 868 aa  218  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>