More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2400 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  62.7 
 
 		 1000 aa  1218    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1004 aa  2042    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 922 aa  462  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 939 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 920 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 944 aa  301  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 987 aa  297  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 935 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 966 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 946 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 947 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 976 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 1057 aa  239  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 951 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 957 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 976 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 1015 aa  235  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 967 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 951 aa  226  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.46 
 
 		 1007 aa  224  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 1040 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 998 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 1007 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 1007 aa  220  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 1007 aa  219  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.65 
 
 		 969 aa  211  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 969 aa  210  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 938 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  25.57 
 
 		 966 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 964 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1028 aa  197  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 1020 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 1032 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 855 aa  191  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 974 aa  189  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 975 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 855 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 981 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 953 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  26.25 
 
 		 961 aa  180  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 966 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 933 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 937 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 901 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 981 aa  168  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 1041 aa  167  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 940 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 985 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 935 aa  164  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 987 aa  163  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 1041 aa  161  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  25.6 
 
 		 929 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 824 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 1001 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1034 aa  144  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1009 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 1088 aa  135  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 924 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 981 aa  131  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 874 aa  131  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 914 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 941 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 950 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 941 aa  125  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 941 aa  125  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 966 aa  125  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 838 aa  124  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 897 aa  124  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1064 aa  124  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 869 aa  124  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 893 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 873 aa  122  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 836 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 944 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 903 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 843 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 913 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1000 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 935 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 906 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 894 aa  119  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 906 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 873 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 956 aa  119  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 906 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 948 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 904 aa  115  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 952 aa  114  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.41 
 
 		 853 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 901 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 930 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 930 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 930 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.22 
 
 		 936 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 958 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 935 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 935 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.76 
 
 		 914 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 935 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 958 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>