More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2243 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  50.35 
 
 		 1020 aa  926    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1000 aa  1966    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 981 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4602  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 875 aa  308  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.683128  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2859  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 902 aa  268  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115194  normal  0.0892472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 875 aa  221  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 869 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 874 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 861 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 927 aa  214  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 861 aa  212  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 861 aa  212  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 861 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 861 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 861 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 857 aa  211  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.1 
 
 		 827 aa  209  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 944 aa  209  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 874 aa  204  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 928 aa  201  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 952 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 879 aa  199  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.59 
 
 		 880 aa  199  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 869 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 901 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 890 aa  195  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 991 aa  195  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 890 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 890 aa  190  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 912 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2047  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 803 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 939 aa  189  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 904 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 956 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 886 aa  185  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 886 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 933 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 910 aa  184  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 948 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 937 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 873 aa  180  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.5 
 
 		 877 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 944 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 897 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 935 aa  177  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 873 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 985 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 924 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 924 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 924 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 908 aa  175  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 884 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  37.35 
 
 		 843 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 974 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 922 aa  173  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 883 aa  171  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 935 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 901 aa  170  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 935 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 935 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.85 
 
 		 853 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 883 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 883 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 1055 aa  167  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 969 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.86 
 
 		 884 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 950 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 894 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 838 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 867 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  25.38 
 
 		 936 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 853 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 867 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 967 aa  164  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 		 709 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 987 aa  164  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 930 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 930 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 836 aa  163  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 981 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 966 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 855 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 855 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 867 aa  162  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 872 aa  161  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 907 aa  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 930 aa  161  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 965 aa  160  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 867 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 975 aa  160  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 856 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 853 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 853 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 853 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 981 aa  157  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 951 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 954 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 901 aa  155  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 985 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 904 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>