More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2904 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  57.48 
 
 		 927 aa  1058    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  57.64 
 
 		 928 aa  1055    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 944 aa  1916    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 948 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 1001 aa  389  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 879 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 874 aa  347  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 991 aa  323  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 871 aa  315  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 869 aa  310  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.78 
 
 		 880 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  27.7 
 
 		 827 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 855 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 852 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 861 aa  297  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 861 aa  296  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 941 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 941 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 941 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 847 aa  294  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  28.8 
 
 		 834 aa  295  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 857 aa  293  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 861 aa  290  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 861 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 861 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 861 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 869 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 875 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 849 aa  280  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 1064 aa  269  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 901 aa  268  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 884 aa  265  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 890 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 890 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 953 aa  262  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  26.98 
 
 		 899 aa  261  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 890 aa  258  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 904 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 910 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 956 aa  254  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  28.16 
 
 		 877 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 985 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 903 aa  251  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 914 aa  251  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 924 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 924 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 894 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 924 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 913 aa  249  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 950 aa  248  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 912 aa  247  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 843 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 966 aa  244  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 906 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 906 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 906 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 908 aa  241  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 952 aa  237  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 901 aa  235  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 836 aa  234  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 944 aa  234  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 873 aa  232  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 982 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 1055 aa  232  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 974 aa  231  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 841 aa  231  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 907 aa  228  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 966 aa  227  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 873 aa  227  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 842 aa  227  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 907 aa  225  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 893 aa  224  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 909 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  28.1 
 
 		 839 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 817 aa  220  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  26.46 
 
 		 866 aa  220  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 935 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 869 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.34 
 
 		 884 aa  219  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 981 aa  219  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 904 aa  214  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 957 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 966 aa  211  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 892 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.15 
 
 		 969 aa  208  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 904 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 912 aa  208  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 938 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1000 aa  207  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 922 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 924 aa  207  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 897 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 876 aa  205  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 944 aa  205  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  25.99 
 
 		 922 aa  205  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 951 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 854 aa  204  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 951 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 904 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 896 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>