More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0162 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 817 aa  1662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  53.14 
 
 		 843 aa  845    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  50.93 
 
 		 853 aa  790    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  53.28 
 
 		 836 aa  837    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  49.77 
 
 		 853 aa  786    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  53.19 
 
 		 839 aa  837    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  49.77 
 
 		 853 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  49.77 
 
 		 853 aa  786    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  53.62 
 
 		 709 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  53.82 
 
 		 841 aa  867    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  51.4 
 
 		 855 aa  818    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  51.63 
 
 		 855 aa  811    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  50.24 
 
 		 842 aa  790    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  50.35 
 
 		 853 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  51.36 
 
 		 838 aa  810    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 869 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  40.64 
 
 		 873 aa  537  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  40.73 
 
 		 873 aa  538  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 904 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 904 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 904 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 904 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 937 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 930 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 930 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 930 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 935 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  32.63 
 
 		 936 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 935 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 935 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 933 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 897 aa  365  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 907 aa  360  5e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 907 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 935 aa  357  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 965 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 901 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 981 aa  345  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 938 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 924 aa  341  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 966 aa  330  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.89 
 
 		 966 aa  321  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 896 aa  299  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 953 aa  293  9e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 852 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 872 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 952 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 861 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 861 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 861 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 891 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 912 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 861 aa  281  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 861 aa  280  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 861 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 935 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 855 aa  277  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 890 aa  276  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 890 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 909 aa  273  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 944 aa  272  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 857 aa  272  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 890 aa  271  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  30.32 
 
 		 827 aa  268  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 847 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 875 aa  266  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 948 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 867 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 910 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 964 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 944 aa  262  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 909 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 957 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 951 aa  257  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 867 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 867 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 869 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 867 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1088 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 985 aa  254  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 871 aa  253  9.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  27.99 
 
 		 929 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 975 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 974 aa  252  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 892 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.77 
 
 		 899 aa  247  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 800 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 869 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 966 aa  245  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.74 
 
 		 895 aa  242  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 896 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 951 aa  242  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.61 
 
 		 893 aa  241  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 924 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 924 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 966 aa  239  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 924 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 969 aa  237  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 920 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 876 aa  230  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>