More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0906 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  67.05 
 
 		 869 aa  1235    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 875 aa  1792    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  41.62 
 
 		 861 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  41.4 
 
 		 861 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  41.51 
 
 		 861 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  41.55 
 
 		 852 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  41.82 
 
 		 847 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 		 857 aa  619  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  40.4 
 
 		 861 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  40.51 
 
 		 861 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  40.51 
 
 		 861 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  40.93 
 
 		 855 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  40.6 
 
 		 871 aa  600  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 		 849 aa  588  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  31.28 
 
 		 827 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 867 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 867 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 866 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 867 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 874 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 867 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 872 aa  347  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 910 aa  347  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 879 aa  343  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 883 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 883 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 883 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 896 aa  337  5e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 924 aa  337  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 924 aa  337  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 924 aa  337  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  32.49 
 
 		 884 aa  336  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 950 aa  334  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 891 aa  332  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 937 aa  324  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 890 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.84 
 
 		 936 aa  320  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 965 aa  318  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 909 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 890 aa  317  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 890 aa  317  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 907 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 930 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 930 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 935 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 935 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 935 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 907 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 933 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 930 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  30.27 
 
 		 880 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 927 aa  302  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  30.68 
 
 		 834 aa  302  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 956 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 894 aa  300  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 924 aa  300  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 909 aa  300  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 935 aa  298  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 869 aa  296  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  28.51 
 
 		 922 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 928 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 873 aa  292  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 896 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 895 aa  290  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 1055 aa  289  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 869 aa  289  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 944 aa  288  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 873 aa  287  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.37 
 
 		 893 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 800 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 876 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 894 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 912 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 925 aa  281  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 981 aa  280  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 904 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  25.97 
 
 		 899 aa  279  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 948 aa  278  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  28.3 
 
 		 877 aa  277  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 901 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 892 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 944 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 841 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 868 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 981 aa  271  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 843 aa  271  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 975 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 951 aa  270  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 884 aa  269  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 1006 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 901 aa  268  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 886 aa  268  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 842 aa  268  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 966 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 886 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 882 aa  265  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 853 aa  264  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 882 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  28.41 
 
 		 866 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 944 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>