More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1621 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  76.07 
 
 		 933 aa  1470    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  84.22 
 
 		 935 aa  1627    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  84.42 
 
 		 936 aa  1647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  99.68 
 
 		 930 aa  1901    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 930 aa  1906    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 930 aa  1906    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  84.22 
 
 		 935 aa  1627    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  84.22 
 
 		 935 aa  1627    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  75.61 
 
 		 937 aa  1464    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  39.88 
 
 		 935 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 953 aa  491  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 981 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  34.43 
 
 		 966 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 1088 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 853 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 853 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 853 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 843 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 838 aa  452  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 966 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 853 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 841 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 987 aa  441  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 965 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 855 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  34.62 
 
 		 853 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 869 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 907 aa  436  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  33.13 
 
 		 985 aa  429  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 855 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 836 aa  429  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 952 aa  422  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 981 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  33.22 
 
 		 839 aa  422  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 873 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 842 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 944 aa  412  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 873 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 974 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 907 aa  405  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 912 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 975 aa  395  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  34.58 
 
 		 709 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 938 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 904 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 904 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 904 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 904 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 817 aa  365  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 901 aa  364  3e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 897 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 957 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 966 aa  353  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 948 aa  345  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  29.35 
 
 		 914 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 924 aa  338  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 946 aa  336  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 951 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 910 aa  328  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 869 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 924 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 924 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 924 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 951 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 944 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 947 aa  318  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 967 aa  318  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 891 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 872 aa  311  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 875 aa  311  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 935 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 855 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 861 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 861 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 861 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 871 aa  302  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.75 
 
 		 961 aa  299  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 861 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 852 aa  299  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 861 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 861 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.79 
 
 		 929 aa  297  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.75 
 
 		 969 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 876 aa  294  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 940 aa  290  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1009 aa  290  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 956 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 849 aa  288  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 847 aa  287  7e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 857 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 973 aa  286  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 969 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 1007 aa  281  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 1028 aa  278  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1015 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.05 
 
 		 1007 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 1007 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 1007 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 890 aa  272  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 890 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>