More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2244 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 892 aa  1826    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  73.16 
 
 		 886 aa  1338    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  78.64 
 
 		 894 aa  1431    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  73.05 
 
 		 886 aa  1335    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  74.69 
 
 		 882 aa  1357    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  74.92 
 
 		 882 aa  1361    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 891 aa  478  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 883 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 883 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 883 aa  366  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 876 aa  365  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 868 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 869 aa  351  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 872 aa  350  9e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  30.65 
 
 		 884 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 909 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 909 aa  337  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 896 aa  328  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 890 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 890 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 855 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 890 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 847 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 852 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 800 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  29.97 
 
 		 827 aa  296  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 924 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 924 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 924 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 873 aa  295  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 857 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 873 aa  290  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 861 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 861 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 861 aa  290  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 849 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 861 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 861 aa  289  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 861 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 907 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 935 aa  282  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 875 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 966 aa  281  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 871 aa  279  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 869 aa  279  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 907 aa  277  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 987 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 841 aa  271  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 869 aa  270  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 836 aa  267  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 855 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 843 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 896 aa  261  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 948 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.66 
 
 		 866 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 838 aa  259  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 855 aa  257  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 924 aa  257  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 933 aa  257  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 930 aa  257  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 853 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 930 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 853 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 853 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 937 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 853 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 930 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.95 
 
 		 853 aa  253  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 966 aa  252  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 935 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 935 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 935 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  26.02 
 
 		 899 aa  251  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.72 
 
 		 839 aa  251  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 895 aa  250  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 944 aa  250  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 901 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 929 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 985 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 904 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 897 aa  244  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 904 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  26.84 
 
 		 893 aa  243  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.06 
 
 		 936 aa  242  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 904 aa  243  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 904 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 981 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 906 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 906 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 906 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 952 aa  238  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 901 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 879 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 967 aa  234  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 817 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 953 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 974 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 975 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 874 aa  233  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 912 aa  230  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>