More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0477 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  48.66 
 
 		 874 aa  768    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 879 aa  1778    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 941 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 941 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 941 aa  486  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 913 aa  475  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 903 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 914 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 906 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 935 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 906 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 906 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 893 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 928 aa  399  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 927 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  32.1 
 
 		 827 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 869 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 944 aa  350  6e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 875 aa  346  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 871 aa  340  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 948 aa  335  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 901 aa  333  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 855 aa  332  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 849 aa  321  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 852 aa  320  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 904 aa  317  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  29.11 
 
 		 877 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 857 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 847 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  30.2 
 
 		 880 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 861 aa  310  9e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 861 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 861 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 861 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 861 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 861 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 872 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 884 aa  300  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 891 aa  291  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 910 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 890 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 890 aa  281  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 866 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 867 aa  277  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 867 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 867 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 867 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 924 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 924 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 924 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1001 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.7 
 
 		 834 aa  267  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 886 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 890 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 854 aa  266  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 930 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 886 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.84 
 
 		 899 aa  266  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 953 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 935 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 935 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 935 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 930 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 883 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 883 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 930 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 869 aa  263  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.54 
 
 		 866 aa  263  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 991 aa  262  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 882 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 896 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 882 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 950 aa  260  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 883 aa  260  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 965 aa  258  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 935 aa  257  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 895 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 909 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  27.68 
 
 		 922 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  27.53 
 
 		 936 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 841 aa  252  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.88 
 
 		 884 aa  252  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 937 aa  251  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 800 aa  250  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 1064 aa  247  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 894 aa  247  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 907 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 925 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 894 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 907 aa  244  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 954 aa  243  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 966 aa  243  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 869 aa  243  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 876 aa  243  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 843 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 933 aa  243  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 892 aa  242  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 956 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 896 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 873 aa  241  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>