More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3813 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 991 aa  2043    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 944 aa  323  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 927 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 928 aa  311  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 874 aa  281  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 884 aa  257  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 879 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 875 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 852 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 869 aa  234  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 930 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 930 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 930 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  25.8 
 
 		 827 aa  229  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 867 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 867 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 867 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 935 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 935 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 867 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 935 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.83 
 
 		 936 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 941 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 941 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 941 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 948 aa  217  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 903 aa  211  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 952 aa  210  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 975 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 876 aa  206  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 933 aa  205  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 935 aa  204  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 907 aa  201  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 935 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 910 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 1000 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 908 aa  195  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 985 aa  194  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 893 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 1064 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 950 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 913 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 894 aa  179  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 892 aa  178  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 924 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 906 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 906 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 906 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 914 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 953 aa  172  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 956 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 800 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 973 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 944 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 951 aa  168  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 924 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  28 
 
 		 922 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 924 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 924 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 886 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 966 aa  163  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 886 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 957 aa  162  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 894 aa  160  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 924 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 882 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 882 aa  160  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1455  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 		 1040 aa  159  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 947 aa  159  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 946 aa  155  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  45.7 
 
 		 861 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  46.24 
 
 		 861 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  45.7 
 
 		 861 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  43.65 
 
 		 849 aa  151  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 854 aa  150  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 940 aa  150  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  38.11 
 
 		 904 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  42.79 
 
 		 861 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  43.55 
 
 		 861 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  43.55 
 
 		 861 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  40.2 
 
 		 877 aa  149  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  44.94 
 
 		 857 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  40.88 
 
 		 871 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  39.42 
 
 		 834 aa  148  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 939 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  40.47 
 
 		 880 aa  147  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 1007 aa  146  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.97 
 
 		 969 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 855 aa  145  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  43 
 
 		 842 aa  145  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 901 aa  145  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 841 aa  145  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 		 901 aa  144  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  44.02 
 
 		 847 aa  144  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  43.69 
 
 		 907 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  24.11 
 
 		 1007 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  42.06 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  42.06 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  42.06 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  42.04 
 
 		 839 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>