More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3922 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 948 aa  1932    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  40.2 
 
 		 1001 aa  671    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 		 1064 aa  504  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 944 aa  429  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 927 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 928 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 874 aa  364  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 879 aa  335  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 941 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 941 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 941 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.59 
 
 		 827 aa  293  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.4 
 
 		 880 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  26.99 
 
 		 895 aa  269  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 903 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 906 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 913 aa  266  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 906 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 906 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.38 
 
 		 899 aa  264  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 935 aa  263  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 869 aa  263  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 914 aa  263  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 871 aa  263  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 896 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 893 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 847 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 852 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 861 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 861 aa  258  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 861 aa  258  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 884 aa  256  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 861 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 855 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 861 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 861 aa  255  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 893 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 875 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 901 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 883 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 883 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 890 aa  244  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 857 aa  243  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 890 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 883 aa  243  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 890 aa  243  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.65 
 
 		 884 aa  241  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 869 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 849 aa  234  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 909 aa  231  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  25.95 
 
 		 877 aa  230  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 876 aa  230  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 904 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 868 aa  227  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 909 aa  226  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 908 aa  226  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 991 aa  219  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 872 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 910 aa  207  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 953 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 904 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 841 aa  197  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 904 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 985 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 951 aa  191  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 1000 aa  191  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 904 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 854 aa  190  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 956 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 904 aa  189  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 933 aa  189  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 944 aa  188  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 892 aa  188  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 957 aa  187  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 907 aa  186  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 892 aa  180  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 976 aa  179  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 924 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 924 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 924 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 935 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 935 aa  171  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 1020 aa  171  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 882 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 894 aa  169  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 966 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  25.36 
 
 		 961 aa  168  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 981 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 886 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 948 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 882 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 886 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 946 aa  164  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 924 aa  163  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 954 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 952 aa  162  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 969 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 1000 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1040 aa  151  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 976 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>