More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0708 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 956 aa  1954    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 855 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 869 aa  311  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 849 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 871 aa  309  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 861 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 875 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 861 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 861 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 852 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 861 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 861 aa  300  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 861 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 847 aa  298  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 930 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 857 aa  293  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 930 aa  293  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 930 aa  293  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.86 
 
 		 827 aa  291  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 933 aa  287  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 890 aa  281  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 890 aa  280  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 937 aa  278  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 935 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 935 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 935 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  27.12 
 
 		 936 aa  270  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 953 aa  269  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 874 aa  267  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 890 aa  262  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.91 
 
 		 966 aa  258  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 910 aa  257  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 944 aa  253  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 944 aa  253  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 927 aa  250  9e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 935 aa  249  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 907 aa  248  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 928 aa  245  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 873 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  28.05 
 
 		 866 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 974 aa  243  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 879 aa  242  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 981 aa  241  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 907 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 950 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 873 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 1055 aa  235  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 987 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 935 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 975 aa  232  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  27.11 
 
 		 914 aa  231  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 944 aa  230  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 966 aa  230  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 952 aa  227  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  27.4 
 
 		 880 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 965 aa  224  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 908 aa  224  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 891 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 966 aa  222  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 909 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 924 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 981 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 904 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 904 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 904 aa  217  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 904 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 901 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 894 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 1001 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 894 aa  213  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 1088 aa  211  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 896 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 920 aa  207  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 951 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 909 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 957 aa  205  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 868 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 882 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 903 aa  201  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 948 aa  201  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1007 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 941 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 941 aa  199  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 882 aa  199  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 941 aa  199  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 892 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 886 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 901 aa  195  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 924 aa  195  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 924 aa  195  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 924 aa  195  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 913 aa  194  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 886 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 892 aa  194  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 947 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 869 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 935 aa  189  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.09 
 
 		 969 aa  188  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 946 aa  188  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 954 aa  187  9e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>