More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01457 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 914 aa  1867    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 952 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 981 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 987 aa  353  5.9999999999999994e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 935 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 935 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 935 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 944 aa  347  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 937 aa  344  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 930 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 930 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 933 aa  340  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 953 aa  340  7e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 930 aa  340  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 981 aa  339  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 974 aa  334  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 869 aa  334  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 873 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 965 aa  332  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.38 
 
 		 936 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 975 aa  325  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 873 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 935 aa  321  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.38 
 
 		 966 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 985 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 966 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 897 aa  300  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 907 aa  300  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 901 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 935 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 1088 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 947 aa  280  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 907 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 946 aa  270  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 951 aa  269  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 1015 aa  260  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 966 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 924 aa  255  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.21 
 
 		 1007 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 951 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 904 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 957 aa  250  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 1007 aa  249  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1007 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 904 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1007 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 944 aa  248  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 938 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 904 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.42 
 
 		 853 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 912 aa  245  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 904 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 853 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 853 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 853 aa  243  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 836 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 853 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 910 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 841 aa  239  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 855 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 838 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 855 aa  237  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 843 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 842 aa  234  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 939 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 879 aa  231  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 976 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 874 aa  228  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.98 
 
 		 969 aa  226  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  26.55 
 
 		 1015 aa  225  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 929 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 956 aa  224  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 940 aa  224  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 982 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.26 
 
 		 880 aa  222  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.52 
 
 		 839 aa  222  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 884 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 966 aa  218  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 1009 aa  217  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 872 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 817 aa  214  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 922 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  25.55 
 
 		 827 aa  208  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 908 aa  207  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 891 aa  207  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.96 
 
 		 877 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 948 aa  207  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 904 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  25.23 
 
 		 961 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 973 aa  204  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 876 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 909 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 869 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 882 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 901 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 1020 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 867 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 896 aa  199  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 882 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 958 aa  197  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>