More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0404 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  100 
 
 
896 aa  1833    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  59.23 
 
 
909 aa  1075    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  60.66 
 
 
909 aa  1097    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 
872 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 
868 aa  452  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 
876 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 
869 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 
800 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 
891 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 
894 aa  348  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 
875 aa  346  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 
882 aa  344  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 
882 aa  343  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 
886 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 
886 aa  334  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 
892 aa  324  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.8 
 
 
884 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 
869 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.41 
 
 
827 aa  306  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 
852 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 
966 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 
890 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 
890 aa  303  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 
883 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  28.37 
 
 
895 aa  299  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 
883 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 
883 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 
861 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 
861 aa  296  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 
861 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
817 aa  293  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 
896 aa  290  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 
853 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
867 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
843 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 
853 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
855 aa  288  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
867 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
866 aa  286  9e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  28.06 
 
 
966 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 
853 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28.24 
 
 
853 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.14 
 
 
899 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 
853 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 
855 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 
857 aa  283  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 
867 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
867 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 
925 aa  282  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 
855 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 
841 aa  280  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  28.47 
 
 
922 aa  280  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
861 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 
849 aa  279  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
861 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
861 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.19 
 
 
893 aa  278  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
838 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.91 
 
 
839 aa  274  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
924 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
924 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
924 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 
847 aa  273  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 
935 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 
935 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 
935 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 
842 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
874 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 
933 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
937 aa  261  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.12 
 
 
936 aa  260  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
871 aa  260  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 
869 aa  260  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
879 aa  259  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 
836 aa  257  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 
930 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 
930 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 
873 aa  254  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
873 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 
930 aa  253  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 
907 aa  252  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 
950 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
935 aa  248  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
907 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 
952 aa  240  9e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 
908 aa  239  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
944 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
912 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  26.28 
 
 
866 aa  230  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
948 aa  230  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 
927 aa  227  9e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.26 
 
 
904 aa  227  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
901 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
928 aa  225  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
965 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  25.8 
 
 
880 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
924 aa  223  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  28.17 
 
 
709 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.16 
 
 
834 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
894 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>